Sejak awal berdirinya, SDIT Insan Utama konsisten menerapkan kurikulum terpadu yakni kurikulum pendidikan nasional dari kementerian Pendidikan Nasional, Kurikulum Jaringan Sekolah Islam Terpadu (JSIT) dan muatan lokal dari Yayasan Insan Utama Yogyakarta. Keterpaduan kurikulum itu pula menajdi salah satu faktor yang mendorong orangtua siswa memilihkan SDIT Insna Utama sebagai tempat pendidikan putra-putrinya. Secara akademik siswa tidak tertinggal dalam pembelajaran, namun di sisi yang lain siswa mendapat pendidikan keagamaan, dibiasakan melakukan ibadah, mengaplikasikan akhlaq dan perilaku yang baik, cinta tanah air dan bangsa.